Le bolet à chair jaune est très ressemblant au bolet tomenteux avec lequel il pousse parfois ; mais les blessures du chapeau ont une coloration rouge.
Il ressemble aussi au bolet bai, qui se distingue par son chapeau en principe visqueux, ses pores fins, jaune sale et bleuissant fortement, et sa chair bleuissant aussi nettement.
Il existe des formes intermédiaires entre le bolet tomenteux et les deux espèces de bolets précédentes.
Le bolet tomenteux ressemble également au bolet ferrugineux (Xerocomus ferrugineus [(Schæff.) Bon, non Beck]), à la chair entièrement blanche ; mais ce dernier est rare.
Xerocomus spadiceus [(Fries) Quélet] est considéré aujourd’hui comme un synonyme de Xerocomus subtomentosus.